Análise da expressão diferencial do transcriptoma da espécie Triportheus albus cope, 1872 nas águas preta, clara e branca da Amazônia

Abstract

Milhares de corpos d’água são encontrados na Amazônia. Eles podem ser classificados conforme sua cor em três categorias, águas preta, clara e branca. Estima-se que 3.000 espécies de peixes vivem nos rios da Amazônia, dentre estas a sardinha, Triportheus albus. Esta espécie habita os três tipos de águas da Amazônia, apesar de suas diferenças significativas em relação aos parâmetros físico-químicos. A capacidade desta espécie para sobreviver nestes diferentes habitats está relacionada com suas adaptações específicas. O objetivo do presente estudo foi descrever a resposta gênica nos três tipos de águas, e descrever os mecanismos relevantes que podem originar essa capacidade. Brânquias de T. albus foram coletadas em locais bem caracterizados para cada tipo de água. Nove bibliotecas de cDNA foram construídas, três réplicas biológicas de cada condição e sequenciado o RNA (RNA-Seq) na Plataforma MiSeq® (Illumina®). Um total de 51,6 milhões de reads paired-end, e 285.456 transcritos foram montados. Considerando o FDR ≤ 0,05 e fold change ≥ 2, foram detectados 13.754 genes diferencialmente expressos nos três desafios ambientais. Dois mecanismos relacionados com a homeostase foram detectados em T. albus que vivem em águas pretas. As águas pretas e ácidas, parece ser um ambiente desafiador para muitos tipos de organismos aquáticos. O primeiro está relacionado com a diminuição da permeabilidade celular e o segundo com a regulação iônica e ácido-base. Sugerimos que a espécie T. albus é uma boa espécie de peixe para futuros estudos envolvendo a regulação iônica e ácido-base de espécies amazônicas.

Palavras-chave: Rio Negro, Rio Tapajós, Rio Solimões, expressão diferencial, RNASeq, pH ácido, regulação iônica.